Цианиновые красители

Цианиновые красители представляют собой молекулы, содержащие цепь из нечетного числа метиновых групп между двумя атомами азота с делокализованным зарядом:

Generic structure of cyanine dyes

Благодаря особенностям структуры, цианины характеризуются очень высокими коэффициентами экстинкции, часто превышающими 100,000 л/моль/см. С помощью различных заместителей можно контролировать такие свойства хромофора как длина волны поглощения, фотостабильность, и флуоресценцию. Например, длину волны поглощения и флуоресценции можно регулировать путем выбора полиметиновых цепочек: длинноцепочечные цианины поглощают в более длинноволновой области, вплоть до ближнего ИК.

Ряд цианиновых красителей используются в приложениях, относящихся к сфере «life science». Некоторые тиазоловые и оксазоловые красители применялись уже давно для мечения белков и ДНК (например, TOTO, YOYO, Stains All и другие). Но наиболее распространенные на данный момент цианиновые красители для научных исследований в области «life science» были синтезированы Аланом Ваггонером с коллегами из Университета Карнеги-Меллон в начале 1990-х годов. Эти красители были получены модификацией цианинового красителя индоцианина зеленого (ICG), который использовался для ангиографии с 1970-х годов. Все они содержат два индолениновых кольца по обеим концам полиметиновой цепочки. У красителей обнаружено свойства слабого неспецифического связывания с биомолекулами, они характеризуются яркой флуоресценцией из-за больших коэффициентов поглощения и хороших квантовых выходов. Вначале будучи закрыты патентами, в настоящее время они уже не защищены авторским правом, так как срок патентов CMU истек. Их можно купить через каталог Lumiprobe в виде ряда реакционноспособных производных N-гидроксисукцинимидных эфиров (NHS-эфиров), малеимидов, азидов для клик-химии, и других производных, пригодных для научных исследований и коммерческого использования.

Есть две разновидности цианиновых красителей: сульфированные и несульфированные цианины. Во многих применениях они взаимозаменяемы, поскольку их спектральные свойства почти идентичны. Как сульфированные, так и несульфированные красители можно использовать для мечения биомолекул, таких как ДНК и белков. Эти два типа красителей различаются своей растворимостью в воде: сульфированные красители водорастворимы, и для их использования в водной среде для мечения не требуется добавлять органический растворитель. Они также менее склонны к агрегации в воде. Есть случаи, когда желательно использование только одного из этих типов красителей (см раздел Сульфированные vs несульфированные цианины ниже).

Несульфированные цианины

Несульфированные красители имеют следующие обозначения: Су3, Cy3.5, Су5, Cy5.5, Cy7 и Cy7.5. Су означает «цианин», а первая цифра - число атомов углерода между индолениновыми группами. Cy2 – производное оксазола, а не индоленина, – является исключением из этого правила. Суффикс 0.5 добавляется для бензоконденсированных цианинов.

Изменение структуры позволяет изменять флуоресцентные свойства молекул, а также закрыть наиболее важную часть видимого и и ближнего ИК-спектра всего несколькими флуорофорами.

Structures of non-sulfonated cyanine dyes from Lumiprobe

Большинство производных несульфонированных цианинов (за исключением гидрохлоридов гидразидов и аминов) имеют низкую растворимость в воде. Когда эти молекулы используюся для мечения биомолекул, в реакционной смеси должен присуствовать органического растворитель (5-20% ДМФА или ДМСО). Цианиновый краситель вначале растворяется в органическом растворителе, и добавляется к раствору биомолекулы (белок, пептид, ДНК, меченная аминогруппой) в соответствующем водном буфере. В случае если конъюгация проходит эффективно, растворитель вступает в реакцию быстрее, прежде чем выпадет в осадок.

Флуоресцентные свойства, несульфонированных цианинов мало зависят от растворителя и прочего окружения молекулы. Спектры поглощения и флуоресценции несульфонированных цианиновых красителей приведены ниже. Absorbance and emission spectra of non-sulfonated cyanine dyes

Сульфированные цианины

В сульфированных цианинах сульфогруппы способствуют растворению молекул красителя в водной фазе. Заряженные сульфогруппы снижают агрегацию молекул красителя и сильно меченных конъюгатов с биомолекулами.

Сульфированные цианины, которые предлагает Lumiprobe, включают в себя сульфо-Cy3, сульфо-Cy5, сульфо-Cy7. Structures of sulfonated cyanine dyes from Lumiprobe

Cульфированные цианины очень хорошо растворимы в воде. Мечение биомолекул с использованием этих реактивов не требует органического растворителя.

Сульфированные vs несульфированные цианины

У обоих типов цианинов весьма схожие флуоресцентные свойства, однако есть некоторые различия в протоколах мечения, которые стоит принять во внимание.

Несульфонированные цианины должны быть растворены в органическом растворителе (ДМФА или ДМСО) перед использованием и добавлены в таком виде к раствору молекулы-мишени в водном буфере. Рекомендованная объемная доля органического растворителя в реакционной смеси при мечении составляет 10% для Cy3, Cy5 и Сy7; для бензоконденсированных аналогов (.5) она равняется 15%. Сульфированные цианины могут быть использованы в водной среде без добавления органического растворителя.

Также имеются различия в способах очистки: если очистка ведется диализом против воды или водного буфера, должны использоваться сульфо-Cy – только в этом случае гарантируется эффективное удаление непрореагировавшего красителя. Реакционные смеси после использования и того и другого типа красителей могут быть очищены с помощью гель-фильтрации, хроматографии (ВЭЖХ, , ионообменной) или электрофореза.

Comparison between Cy and sulfo-Cy dyes

Cульфированные и несульфированные цианины взаимозаменяемы для мечения многих классов молекул, включая:

  • растворимые в воде белки, которые нечувствительны к добавлению органического растворителя
  • антитела (используйте 5-10% ДМСО/ДМФА)
  • ДНК и олигонуклеотиды
  • пептиды
  • многие небольшие молекулы

Конъюгаты, полученные с использованием сульфированных и несульфированных аналогов (например, сульфо-Су5 и Су5), очень схожи по флуоресцентным свойствам, и их можно исследовать во многих типах флуориметров

Однако допустимо использовать только сульфированные цианины, если конъюгация ведется:

  • c чувствительными белками, которые денатурируют под действием ДМФА или ДМСО
  • c белками, очистка которых потом осуществляется с помощью диализа
  • c наночастицами в водных soluitons
  • c нерастворимыми или гидрофобными белками

Несульфированные цианины должны быть использованы для:

    • реакций в органических средах (дихлорметан, ацетонитрил)

Lumiprobe предлагает следующие цианиновые продукты.

ФлуорофорРеакционноспособная форма
sulfo-Cy3 NHS ester
azide
carboxylic acid
sulfo-Cy5 NHS ester
azide
alkyne
carboxylic acid
sulfo-Cy7 NHS ester
carboxylic acid
Cy3 NHS ester
maleimide
azide
alkyne
carboxylic acid
Cy3.5 NHS ester
azide
carboxylic acid
Cy5 NHS ester
maleimide
azide
alkyne
hydrazide
amine
carboxylic acid
Cy5.5 NHS ester
maleimide
azide
alkyne
carboxylic acid
Cy7 NHS ester
maleimide
azide
amine
carboxylic acid
Товар добавлен. Просмотрите корзину покупок или оформите заказ
Введено некорректное число товаров для добавления.