Инструкция к набору LumiMag® BB для выделения ДНК на магнитных частицах из цельной крови и буккального эпителия
Набор предназначен для быстрого и высокоэффективного выделения геномной ДНК из цельной крови и соскобов эпителия на магнитных частицах. Он совместим с автоматическими рабочими станциями KingFisher™ Flex, MagMAX™ Express-96, KingFisher™ Duo Prime, KingFisher™ mL, а также подходит для ручного выделения ДНК с использованием магнитного штатива.
Полученная ДНК не содержит примесей белков, подходит для проведения ПЦР, обработки эндонуклеазами рестрикции, Саузерн-блоттинга, подготовки образцов для секвенирования по методу Сэнгера и NGS-секвенирования.
Состав набора
Компонент набора | Количество | ||
---|---|---|---|
11753 10 minipreps |
31753 100 minipreps |
||
B1315, Магнитные частицы / Magnetic Beads (100 мг/мл), 200 uL | 1 | — | |
22850, Протеиназа К / Proteinase К (лиофилизованная), 10 mg | 1 | — | |
F4150, Лизирующий раствор BB / Lysis Solution BB, 4 mL | 2 | — | |
G6450, Промывочный раствор MAG A / Wash Solution MAG A (с GuHCl), 5 mL | 1 | — | |
D1315, Магнитные частицы / Magnetic Beads (100 мг/мл), 2 mL | — | 1 | |
62850, Протеиназа К / Proteinase К (лиофилизованная), 100 mg | — | 1 | |
P4150, Лизирующий раствор BB / Lysis Solution BB, 35 mL | — | 2 | |
S6450, Промывочный раствор MAG A / Wash Solution MAG A (с GuHCl), 50 mL | — | 1 | |
C3850, Буфер для растворения протеиназы К / Proteinase K Dilution Buffer, 1 mL | 1 | 1 | |
K2250, Промывочный раствор B / Wash Solution B (концентрат 5x для разбавления 96% этанолом), 10.0 mL | 1 | 1 | |
K1350, Элюирующий буфер / Elution Buffer (10 мМ Tris-HCl, pH 8.5), 10 mL | 1 | 1 |
Хранить при комнатной температуре.
Срок хранения 12 месяцев.
Необходимое оборудование и материалы, не входящие в состав набора:
- Автоматическая рабочая станция (KingFisher™ Flex, MagMAX™ Express-96, KingFisher™ Duo Prime, KingFisher™ mL) / магнитный штатив
- При использовании магнитного штатива: пробирки типа эппендорф объемом 1,5 мл (2 пробирки для выделения ДНК из 1 образца)
- 96% этанол
- Натрий-фосфатный буфер (PBS) для выделения ДНК из соскобов эпителия
- (опционально) шейкер для планшетов
- Расходный пластик при использовании автоматической рабочей станции:
KingFisher™ Flex Purification System или MagMAX™ Express-96 Deep Well Magnetic Particle Processor | |
---|---|
95040460 | 96-луночный планшет Microtiter DW с глубокими лунками |
97002540 | Планшет KingFisher 96 KF 200 мкл |
97002534 | Гребенка наконечников KingFisher 96 для 96 магнитов DW-формат |
Адгезивная фольга для заклеивания планшетов |
KingFisher™ Duo Prime | |
---|---|
97003530 | Набор Combi для KingFisher Duo для планшета Microtiter с глубокими лунками (набор планшетов, гребенок наконечников и стрипов для элюирования) |
или | |
97003520 | Стрип для элюирования для KingFisher Duo |
97003500 | Гребенка наконечников (12-канальные) для 96-лун. планшета Microtiter с глубокими лунками |
95040460 | 96-луночный планшет Microtiter с глубокими лунками |
KingFisher™ mL | |
---|---|
97002141 | KingFisher mL Combi 240 (набор стрипов и гребенок наконечников) |
или | |
97002111 | Гребенка наконечников KingFisher mL |
97002121 | Стрип KingFisher mL |
Перед началом работы
- Разбавьте концентрат промывочного раствора B в 5 раз 96% этанолом (к указанному на банке объему концентрата добавьте 4 объема 96% этанола), поставьте отметку о добавлении этанола на крышке.
- Добавьте 1 мл буфера для растворения протеиназы К в пробирку с лиофилизованной протеиназой К, тщательно перемешайте, сбросьте капли центрифугированием. ! Раствор протеиназы К после приготовления хранить в морозилке при −20°С.
- При наличии осадка в лизирующем растворе BB и промывочном растворе MAG А прогрейте их в термостате до температуры не выше +50°С и дождитесь полного растворения осадка.
- В случае использования шейкера для планшетов, подберите оптимальные условия для эффективного перемешивания:
- Убедитесь, что планшет плотно фиксируется в шейкере.
- Добавьте в лунки планшета 1 мл воды и накройте планшет фольгой. Определите максимальную скорость шейкера, при которой вода из лунок не выплескивается на фольгу.
Подготовка образцов
Соскобы эпителия:
- Добавьте в чистую 1,5 мл пробирку 1 мл PBS.
- Тщательно промойте в PBS палочку с соскобом эпителия. Отрежьте верхнюю часть палочки, закройте пробирку.
- Встряхните содержимое пробирки с помощью вортекса в течение 2-3 минут.
- В качестве образца используйте 200 мкл супернатанта.
Цельная кровь: Тщательно перемешайте пробирку с кровью и используйте 200 мкл в качестве образца.
Выделение ДНК с использованием автоматической рабочей станции KingFisher™ Flex, MagMAX™ Express-96
- Подготовьте планшеты для автоматической обработки образцов на приборе согласно таблице ниже. ! Заклейте адгезивной фольгой приготовленные планшеты с растворами до загрузки в прибор для предотвращения контаминации и испарения растворов.
ID планшета | Позиция планшета в приборе | Тип планшета | Реагент | Объем на лунку |
---|---|---|---|---|
Wash Plate 1 | 2 | С глубокими лунками | Промывочный раствор MAG A | 500 мкл |
Wash Plate 2 | 3 | С глубокими лунками | Промывочный раствор B | 500 мкл |
Elution | 4 | Стандартный | Элюирующий буфер | 90 мкл |
Tip Comb | 5 | Стандартный | Поместите гребенку наконечников в планшет |
- Тщательно ресуспендируйте суспензию магнитных частиц на вортексе.
- В отдельной пробирке приготовьте смесь магнитных частиц с раствором протеиназы К по схеме: 30 мкл смеси на 1 образец = 20 мкл суспензии магнитных частиц + 10 мкл раствора протеиназы К.
- Тщательно перемешайте смесь магнитных частиц и протеиназы К. Внесите по 30 мкл смеси в лунки планшета (с глубокими лунками).
- Добавьте по 200 мкл образца цельной крови/соскоба эпителия (см. раздел Подготовка образцов) к смеси магнитных частиц и протеиназы К.
- Тщательно перемешайте содержимое лунок планшета:
- С использованием шейкера для планшетов 2 минуты при максимальных оборотах (предварительно определив максимальные обороты, см. раздел Перед началом работы),
- ИЛИ
- Пипетированием, после чего инкубируйте 2 минуты при комнатной температуре.
- Добавьте в лунки по 700 мкл Лизирующего раствора BB.
- Переходите к процедуре автоматической обработки образцов на приборе. Для этого выберите соответствующую программу на приборе и запустите ее. Используйте программу MagMAX_CORE:
Название прибора | Название программы с нагревом | Название программы без нагрева (опционально) |
---|---|---|
KingFisher™ Flex | MagMAX_CORE_Flex.bdz | MagMAX_CORE_Flex_no_heat.bdz |
KingFisher™ 96 MagMAX™ Express-96 | MagMAX_CORE_KF-96.bdz | MagMAX_CORE_KF-96_no_heat.bdz |
- Следуя указаниям прибора, поместите в прибор подготовленные планшеты с растворами (п.1) и с образцами (п.7).
Хранение выделенной ДНК: в морозильной камере (−20°С), кратковременно при +4°С.
Выделение ДНК с использованием автоматической рабочей станции KingFisher™ Duo Prime, KingFisher™ mL
- Тщательно ресуспендируйте суспензию магнитных частиц на вортексе.
- В отдельной пробирке приготовьте смесь магнитных частиц с раствором протеиназы К по схеме: 30 мкл смеси на 1 образец = 20 мкл суспензии магнитных частиц + 10 мкл раствора протеиназы К.
- Тщательно перемешайте смесь магнитных частиц и протеиназы К. Внесите по 30 мкл смеси в лунки планшета/стрипа.
- Добавьте по 200 мкл образца цельной крови/соскоба эпителия (см. раздел Подготовка образцов) к смеси магнитных частиц и протеиназы К.
- Тщательно перемешайте содержимое лунок планшета/стрипа:
- С использованием шейкера для планшетов 2 минуты при максимальных оборотах (предварительно определив максимальные обороты, см. раздел Перед началом работы),
- ИЛИ
- При работе со стрипами для KingFisher™ mL: пипетированием, после чего инкубируйте 2 минуты при комнатной температуре.
- Добавьте в лунки по 700 мкл Лизирующего раствора BB.
- Добавьте Промывочный раствор MAG A, Промывочный раствор B, Элюирующий буфер и образцы в соответствующие лунки планшета/стрипа согласно таблице ниже. Загружайте на прибор гребенки наконечников и приготовленные согласно таблице готовые планшеты/стрипы одновременно.
KingFisher™ Duo Prime | ||||
---|---|---|---|---|
ID ряда | Ряд в планшете | Тип планшета | Реагент | Объем на лунку |
Sample | A | С глубокими лунками | Образец (полученный в п.6) | 930 мкл |
Wash 1 | B | Промывочный раствор MAG A | 500 мкл | |
Wash 2 | C | Промывочный раствор B | 500 мкл | |
Elution | Отдельный стрип | Стрип для элюирования | Элюирующий буфер | 90 мкл |
Tip Comb | H | С глубокими лунками | Поместите гребенку наконечников в планшет |
KingFisher™ mL | ||||
---|---|---|---|---|
ID позиции | Позиция стрипа в приборе | Лунка | Реагент | Объем на лунку |
Sample | 1 | Стандартная | Образец (полученный в п.6) | 930 мкл |
Wash 1 | 2 | Промывочный раствор MAG A | 500 мкл | |
Wash 2 | 3 | Промывочный раствор B | 500 мкл | |
Elution | 4 | Элюирующий буфер | 90 мкл | |
Tip Comb | — | — | Поместите гребенку в держатель. |
- Переходите к процедуре автоматической обработки образцов на приборе. Для этого выберите соответствующую программу на инструменте и запустите ее.
Используйте программу MagMAX_CORE:
Название прибора | Название программы с нагревом |
Название программы без нагрева |
---|---|---|
KingFisher™ Duo Prime | MagMAX_CORE_DUO.bdz | MagMAX_CORE_DUO_no_heat.bdz |
KingFisher™ mL | — | MagMAX_CORE_mL_no_heat.bdz |
Хранение выделенной ДНК: в морозильной камере (−20°С), кратковременно при +4°С.
Выделение ДНК с использованием магнитного штатива
- Тщательно ресуспендируйте суспензию магнитных частиц на вортексе.
- В отдельной пробирке приготовьте смесь магнитных частиц с раствором протеиназы К по схеме: 30 мкл смеси на 1 образец = 20 мкл магнитных частиц + 10 мкл раствора протеиназы К.
- Тщательно перемешайте смесь магнитных частиц и протеиназы К. Внесите по 30 мкл смеси в отдельные пробирки, совместимые с магнитным штативом.
- Добавьте по 200 мкл образца цельной крови/соскоба эпителия (см. раздел Подготовка образцов) в пробирку со смесью магнитных частиц и протеиназы К.
- Тщательно перемешайте содержимое пробирки на вортексе. Инкубируйте 2 минуты при комнатной температуре.
- Добавьте в каждую пробирку 700 мкл Лизирующего раствора BB. Тщательно перемешайте на вортексе.
- Поместите пробирки в магнитный штатив. Подождите, пока магнитные частицы полностью перейдут в осадок. Тщательно удалите супернатант (например, с помощью дозатора).
- Добавьте 500 мкл Промывочного раствора MAG A, тщательно перемешайте на вортексе или пипетированием. Поместите пробирки в магнитный штатив, после осаждения частиц удалите супернатант.
- Добавьте 500 мкл Промывочного раствора B, тщательно перемешайте на вортексе или пипетированием. Поместите пробирки в магнитный штатив, после осаждения частиц удалите супернатант.
- Добавьте 90 мкл Элюирующего буфера, тщательно перемешайте на вортексе или пипетированием. Инкубируйте 5 минут при комнатной температуре. Поместите пробирки в магнитный штатив, после осаждения частиц супернатант содержит выделенную геномную ДНК. Перенесите супернатант в новую чистую пробирку.
Хранение выделенной ДНК: в морозильной камере (−20°С), кратковременно при +4°С.
Наборы
LumiMag® BB, набор для выделения ДНК на на магнитных частицах из цельной крови и буккального эпителия
Набор на магнитных частицах для высокоэффективного выделения геномной ДНК из цельной крови и соскобов эпителия. Совместим с автоматическими рабочими станциями и ручным выделением с использованием магнитного штатива.Артикул | Фасовка | Цена | Срок поставки | Купить товар |
---|---|---|---|---|
по запросу. Наличие данного продукта уточняйте, пожалуйста, |