HEX фосфорамидит, 6-изомер
Артикул | Фасовка | Цена | Срок поставки | Купить товар |
---|---|---|---|---|
CB260 | 100 mg | – | 5 д | |
DB260 | 250 mg | $272 | в наличии | |
FB260 | 1 g | $575 | в наличии | |
GB260 | 5 g | $2640 | в наличии | |
HB260 | 10 g | по запросу | в наличии |
HEX фосфорамидит для олигонуклеотидного синтеза, чистый 6-изомер.
HEX (гексахлорфлуоресцеин) — производное флуоресцеина с эмиссией в желтой области спектра (максимум поглощения и испускания при 533 нм и 549 нм соответственно).
HEX фосфорамидит применяется для синтеза флуоресцентно-меченых праймеров, а также гибридизационных зондов типа TaqMan, Molecular Beacon, Scorpion для количественной ПЦР, при этом наиболее эффективно HEX используется вместе с нефлуоресцирующим тушителем DusQ 1 из-за значительного перекрытия их спектров (удобно использовать вместе с носителем DusQ 1 CPG 500 с размером пор 500 Å). Многие секвенаторы для проведения капиллярного электрофореза содержат канал детекции для HEX. По этой причине данный фосфорамидит часто используется для синтеза 5’-меченых олигонуклеотидов для фрагментного анализа, в частности для микросателлитного анализа, в ходе которого с помощью флуоресцентно-меченого прямого праймера и немеченого обратного праймера амплифицируют микросателлитные локусы.
Рекомендации по использованию реагента:
Конденсация: 3 минуты.
Деблокирование: стандартные условия с использованием 25% аммиака; время деблокирования определяется набором нуклеиновых оснований и их защитными группами (деблокирование в течение 17 часов при 55 °С удаляет все защитные группы со стандартных нуклеиновых оснований). Допустимо использование AMA (смесь 1:1, концентрированный водный аммиак / 40% водный метиламин), при этом образование нефлуоресцентного побочного продукта ~5%. Во избежание образования побочного продукта начните деблокирование с использованием аммиака (30 минут при комнатной температуре), затем добавьте равный объем 40% водного метиламина и продолжите деблокирование как обычно с использованием AMA (например, 10 минут при 65 °С).
Спектры поглощения и эмиссии HEX
С этим продуктом также покупают
DusQ 3 CPG 500
DusQ 3 - тушитель для дальнего красного и ближнего ИК-диапазона. Особенно хорошо подходит для красителя Cyanine5.5. Этот носитель предназначен для синтеза олигонуклеотидов с красителем на 3'-конце.DusQ 1 фосфорамидит
Фосфорамидит для синтеза олигонуклеотидов, меченых тушителем DusQ 1 на 5’-конце. Применяется в комбинации с флуорофорами HEX, JOE, ROX, Cyanine3.Cyanine5.5 фосфорамидит
Амидит для синтеза олигонуклеотидов и зондов для ПЦР в реальном времени, содержащих флуорофор Cyanine5.5 на 5'-конце. Зонды с данным красителем могут использоваться в мультиплексной ПЦР.Общие свойства
Вид продукта: | бесцветное твердое вещество |
Молекулярная масса: | 1050.61 |
CAS-номер: | 1360547-55-2 |
Брутто-формула: | C46H52N3Cl6O10P |
Растворимость: | Хорошо растворим в ацетонитриле и дихлорметане |
Контроль качества: | ЯМР 1H и ВЭЖХ-МС (95+%) |
Условия хранения: | Хранение: 12 месяцев (с момента доставки) при -20°C в темноте. Транспортировка: до трех недель при комнатной температуре. Избегайте хранения на свету. Берегите от влаги. |
Паспорт безопасности: | Скачать |
Спецификация продукта |
Спектральные свойства
Максимум возбуждения/поглощения, нм: | 533 |
ε, л⋅моль−1⋅см−1: | 87770 |
Длина волны флуоресценции, нм: | 549 |
Квантовый выход флуоресценции: | 0.57 |
CF260: | 0.30 |
CF280: | 0.13 |
Олигонуклеотидный синтез
Растворитель: | сухой ацетонитрил (растворить до концентрации 0.1 М, хранение - 1 неделя). |
Условия конденсации: | стандартные, как для носителей с природными нуклеотидами |
Условия деблокирования: | идентичные защищенным природным нуклеотидам |