
Реакционная смесь для кПЦР ProbeMaster® ROX+UDG, 2×
Смесь для кПЦР ProbeMaster ROX+UDG подходит для точного определения содержания ДНК матрицы в пробе и может применяться для определения уровня копийности и экспрессии генов, генотипирования и детекции SNP, и др. Готовая 2-х кратная реакционная смесь содержит все необходимые компоненты для проведения количественной ПЦР, ее состав оптимизирован для получения идеальных результатов с минимальным значением порогового цикла и высоким уровнем отношения сигнал/фон. Смесь ProbeMaster позволяет решить большое количество задач с минимальными затратами времени. Полимераза с технологией "горячего старта" предотвращает неспецифическую амплификацию, а урацил-ДНК-гликозилаза* исключает кросс-контаминацию и получение ложноположительных результатов. Для детекции флуоресценции следует использовать ДНК-зонд, меченный флуорофором и тушителем (гидролизуемые зонды, "молекулярные маяки", праймеры типа "скорпион") или два зонда, меченных флуорофорами, образующими FRET-пару (вы можете заказать синтез зондов в Lumiprobe). Помимо ДНК-зондов, для детекции флуоресценции может использоваться интеркалирующий краситель dsGreen (dsGreen). Нормировка сигнала осуществляется с помощью входящего в состав смеси референсного красителя ROX - реагента производства Lumiprobe. Концентрация ROX была специально оптимизирована для работы на большинстве real-time амплификаторов, доступных на рынке. Для постановки реакции просто смешайте в пробирке смесь для кПЦР ProbeMaster, праймеры, зонд/интеркалирующий краситель, ДНК и воду. 1 мл реакционной смеси рассчитан на проведение 100 реакций объёмом 20 мкл.
Формат ПЦР: количественная ПЦР (ПЦР-РВ) с применением интеркалирующих красителей или гидролизуемых зондов
Состав реакционной смеси: HS Taq ДНК-полимераза, смесь дезоксинуклеозидтрифосфатов (включая dUTP), урацил-ДНК-гликозилаза (UDG), ПЦР-буфер (содержит Mg2+), референсный краситель ROX
Совместимость с оборудованием: совместим с большинством real-time амплификаторов, в том числе производства Applied Biosystems (7300, 7500, 7500 Fast, 7900HT, QuantStudio 12k Flex, QuantStudio 3, QuantStudio 5, QuantStudio 6 Flex, QuantStudio 7, StepOne, StepOnePlus, ViiA 7 System), Bio-Rad (CFX384, CFX 96, iQ5), Roche (LC 480), Stratagene (MX3000P, MX3005P, MX4000) и др.
Ключевые характеристики смеси:
- Для постановки реакции в смесь необходимо добавить интеркалирующий краситель или зонд для детекции продукта амплификации, образец ДНК, праймеры и воду.
- Референсный краситель ROX позволяет нормировать интенсивность флуоресценции зондов и интеркалирующих красителей типа dsGreen.
- В состав смеси входят урацил-ДНК-гликозилаза (UDG) и dUTP для предотвращения кросс-контаминации продуктами реакции.**
- Подходит для ПЦР фрагментов длиной до 3 тыс. п.о., не более 70% GC, не требующих высокоточной амплификации.
- В качестве матрицы может использоваться геномная, вирусная, плазмидная ДНК и др.
- Формат готовой реакционной смеси снижает риск контаминации образцов.
- В состав реакционной смеси входит Taq-полимераза с технологией "горячего старта" (Hot Start). Используемая HS Taq ДНК-полимераза представляет собой комплекс моноклональных антител с ферментом. Прогрев образца в первом цикле ПЦР приводит к инактивации антител в составе комплекса и активирует фермент. Технология "горячего старта" позволяет предотвратить неспецифическую амплификацию и образование димеров праймеров.
- HS Taq ДНК-полимераза обладает 5'-3' полимеразной, 5'-3' экзонуклеазной, аденилтрансферазной активностью.
*Мы также предлагаем реакционную смесь, не содержащую урацил-ДНК-гликозилазу (UDG) и dUTP - ProbeMaster ROX qPCR mix.
**при полной замене dTTP на dUTP в реакционной смеси, все ПЦР-ампликоны содержат вместо тимина (Т) урацил (U). Урацил-ДНК-гликозилаза отщепляет основания урацила от сахарофосфатного остова одно- и двуцепочечной ДНК, но не воздействует на тимин-содержащую ДНК. Апиримидиновые сайты блокируют работу ДНК-полимеразы и подвержены гидролитическому расщеплению при повышенной температуре. Для работы фермента необходимо включить в протокол стадию предобработки образца в виде дополнительного цикла ПЦР (5 мин, 50 °С). Последующая температурная инактивация урацил-ДНК-гликозилазы, а также разрушение ампликонов с выщепленным урацилом осуществляется на стадии предварительной денатурации ДНК.
Таблица подбора мастер микса для ПЦР
Реакционные смеси для количественной ПЦР (ПЦР-РВ) | ||||
---|---|---|---|---|
Название смеси | dsGreen | ROX | UDG, dUTP | Применение |
ProbeMaster ROX+UDG qPCR mix Cat.# •5214 | — | ✔ | ✔ | кПЦР с ДНК-зондами или интеркалирующим красителем |
ProbeMaster ROX qPCR mix Cat.# •5114 | — | ✔ | — | |
ProbeMaster dsGreen+ROX qPCR mix Cat.# •5514 | ✔ | ✔ | — | кПЦР с интеркалирующим красителем |
All-in-one qPCR master mix Cat.# •5414 | ✔ | ✔ | ✔ | |
All-in-one no ROX qPCR master mix Cat.# •5314 | ✔ | — | ✔ | |
Реакционная смесь для стандартной ПЦР | ||||
Basic PCR master mix Cat.# •5024 | — | — | — | ПЦР с последующим анализом методом гель-электрофореза, содержит краситель для нанесения на гель |
Универсальная реакционная смесь | ||||
PCR/qPCR master mix Cat.# •5534 | — | — | — | кПЦР с ДНК-зондами/интеркалирующим красителем или стандартная ПЦР с последующим анализом методом гель-электрофореза |
Рекомендуемый протокол
Калькулятор
С этим продуктом также покупают
ProteOrange® Protein Gel Stain, 5000×
ProteOrange® - флуоресцентный краситель для прокрашивания белков в гелях, аналог SYPRO orange. Он обеспечивает более высокую чувствительность, чем Кумасси.Краситель PreciseGreen® для определения концентрации двухцепочечной ДНК, 200×
PreciseGreen® - краситель для точного определения концентрации двухцепочечной ДНК в присутствии РНК, одноцепочечной ДНК и других примесей. Этот краситель в присутствии дцДНК начинает ярко флуоресцировать в канале FAM. Флуоресцентный сигнал прямо пропорционален концентрации ДНК в образце в диапазоне от десятков пг/мл до сотен нг/мл.dsGreen® для ПЦР реального времени, 100×
Флуоресцентный краситель для детекции амплификации в ПЦР реального времени в готовом 100×-растворе для добавления в мастер-микс.Общие свойства
Паспорт безопасности: | Скачать |
Спецификация продукта |
