TAMRA фосфорамидит, 5-изомер
Общие свойства
Спектры поглощения и эмиссии TAMRA фосфорамидит, 5-изомер
Олигонуклеотидный синтез
| АРТИКУЛ | ФАСОВКА | ЦЕНА | СРОК ПОСТАВКИ | КУПИТЬ ТОВАР |
|---|---|---|---|---|
2497-100mg | 100 mg | по запросу | 21 д. | |
2497-1g | 1 g | по запросу | 21 д. | |
2497-250mg | 250 mg | по запросу | 21 д. | |
2497-5g | 5 g | по запросу | 21 д. |
Данный фосфорамидит используется для синтеза олигонуклеотидов, меченых TAMRA на 5’-конце.
TAMRA (карбокситетраметилродамин) — ксантеновый краситель родаминового ряда с эмиссией в оранжевой области спектра (максимум на 563 нм). Данный флуорофор традиционно используется в качестве FRET-акцептора (и тушителя) в паре с флуоресцеином (FAM) благодаря значительному перекрытию их спектров. Поэтому данный фосфорамидит удобно использовать для синтеза дважды меченых зондов TaqMan, содержащих TAMRA на 5’-конце и FAM в середине последовательности или на 3’-конце (с использованием Флуоресцеин dT фосфорамидита и FAM CPG соответственно).
5’-меченые красителем TAMRA олигонуклеотиды часто используются для количественной ПЦР и фрагментного анализа (например, для анализа микросателлитов), поскольку доступное оборудование часто имеет канал детекции для TAMRA.
Поскольку краситель TAMRA не стабилен в присутствие аммиака и первичных стерически незатрудненных аминов, настоятельно рекомендуется соблюдать указанные условия деблокирования меченых олигонуклеотидов.
Рекомендации по использованию реагента:
Конденсация: 7,5 минут.
Деблокирование: раствор трет-бутиламин : метанол : вода в соотношении 1:1:3 по объему («TAMRA cocktail») в течение 6 часов при 60 °С; затем охладить до комнатной температуры.
Для деблокирования с твердофазного носителя модифицированного олигонуклеотида НЕ допускается использовать водный аммиак и AMA из-за полной и необратимой деградации красителя TAMRA.