TAMRA фосфорамидит, 5-изомер
Артикул | Фасовка | Цена | Срок поставки | Купить товар |
---|---|---|---|---|
2497-100mg | 100 mg | по запросу | в наличии (3 шт.) | |
2497-250mg | 250 mg | по запросу | в наличии (2 шт.) | |
2497-1g | 1 g | по запросу | в наличии (2 шт.) | |
2497-5g | 5 g | по запросу | в наличии (2 шт.) |
Данный фосфорамидит используется для синтеза олигонуклеотидов, меченых TAMRA на 5’-конце.
TAMRA (карбокситетраметилродамин) — ксантеновый краситель родаминового ряда с эмиссией в оранжевой области спектра (максимум на 563 нм). Данный флуорофор традиционно используется в качестве FRET-акцептора (и тушителя) в паре с флуоресцеином (FAM) благодаря значительному перекрытию их спектров. Поэтому данный фосфорамидит удобно использовать для синтеза дважды меченых зондов TaqMan, содержащих TAMRA на 5’-конце и FAM в середине последовательности или на 3’-конце (с использованием Флуоресцеин dT фосфорамидита и FAM CPG соответственно).
5’-меченые красителем TAMRA олигонуклеотиды часто используются для количественной ПЦР и фрагментного анализа (например, для анализа микросателлитов), поскольку доступное оборудование часто имеет канал детекции для TAMRA.
Поскольку краситель TAMRA не стабилен в присутствие аммиака и первичных стерически незатрудненных аминов, настоятельно рекомендуется соблюдать указанные условия деблокирования меченых олигонуклеотидов.
Рекомендации по использованию реагента:
Конденсация: 7,5 минут.
Деблокирование: раствор трет-бутиламин : метанол : вода в соотношении 1:1:3 по объему («TAMRA cocktail») в течение 6 часов при 60 °С; затем охладить до комнатной температуры.
Для деблокирования с твердофазного носителя модифицированного олигонуклеотида НЕ допускается использовать водный аммиак и AMA из-за полной и необратимой деградации красителя TAMRA.
Спектры поглощения и эмиссии 5-TAMRA
С этим продуктом также покупают
BDP® 650/665 азид
BDP 650/665 - краситель на основе бордипиррометена с эмиссией в красной области. Это азидное производное можно конъюгировать с алкинами в присутствии катализатора - соединений меди (I) или с циклоалкинами без катализатора.DusQ 1 dT фосфорамидит
Фосфорамидит применяется для DusQ 1 dT мечения олигонуклеотидов.DusQ 2 CPG 500
Модифицирующий носитель на основе пористого стекла CPG 500 для синтеза олигонуклеотидов, содержащих тушитель DusQ 2 на 3’-конце. Совместим со стандартными условиями деблокирования.Общие свойства
Вид продукта: | твёрдое вещество малинового цвета |
Инкремент массы молекулярного иона: | 589.60 |
Молекулярная масса: | 727.83 |
Брутто-формула: | C40H50N5O6P |
Растворимость: | хорошая в ацетонитриле, дихлорметане |
Контроль качества: | ЯМР 1H, ВЭЖХ-МС (95%), тест на конденсацию |
Условия хранения: | Хранение: 12 месяцев (с момента доставки) при -20°C в темноте. Транспортировка: до трех недель при комнатной температуре. Избегайте хранения на свету. Берегите от влаги. |
Паспорт безопасности: | Скачать |
Спецификация продукта |
Спектральные свойства
Максимум возбуждения/поглощения, нм: | 541 |
ε, л⋅моль−1⋅см−1: | 84000 |
Длина волны флуоресценции, нм: | 567 |
CF260: | 0.32 |
CF280: | 0.19 |
Олигонуклеотидный синтез
Растворитель: | сухой ацетонитрил (растворить до концентрации 0.1 М, хранение - 1 неделя). |