Общие свойства

Вид продукта: красное твёрдое вещество
Инкремент массы молекулярного иона: 589.60
Молекулярная масса: 727.83
Брутто-формула: C40H50N5O6P
Растворимость: хорошая в ацетонитриле, дихлорметане
Контроль качества: ЯМР 1H и 31P, ВЭЖХ-МС (95%), функциональное тестирование
Условия хранения: Хранение: 12 месяцев (с момента доставки) при -20°C в темноте. Транспортировка: до трех недель при комнатной температуре. Избегайте хранения на свету. Берегите от влаги.

Спектры поглощения и эмиссии TAMRA фосфорамидит, 6-изомер

Максимум возбуждения/поглощения, нм:541
ε, л⋅моль⁻¹⋅см⁻¹:84000
Длина волны флуоресценции, нм:567
CF260:0.32
CF280:0.19
Таблица флуоресцентных меток

Олигонуклеотидный синтез

Условия конденсации: время конденсации - 7,5 мин
Условия деблокирования: Раствор трет-бутиламин : метанол : вода в соотношении 1:1:3 по объему («TAMRA cocktail») в течение 6 часов при 60 °С; затем охладить до комнатной температуры. Для деблокирования с твердофазного носителя модифицированного олигонуклеотида НЕ допускается использовать водный аммиак и AMA из-за полной и необратимой деградации красителя TAMRA.
В наличии
$149.90
АРТИКУЛФАСОВКАЦЕНАСРОК ПОСТАВКИКУПИТЬ ТОВАР
2318-100mg
100 mg
$149.90
В наличии
2318-1g
1 g
$919.90Бесплатная доставка при заказе от $400.00
В наличии
2318-250mg
250 mg
$429.90Бесплатная доставка при заказе от $400.00
В наличии
2318-5g
5 gпо запросуВ наличии

Данный фосфорамидит используется для синтеза олигонуклеотидов, меченых TAMRA на 5′-конце.

TAMRA (карбокситетраметилродамин) — ксантеновый краситель родаминового ряда с эмиссией в оранжевой области спектра (максимум на 563 нм). Данный флуорофор традиционно используется в качестве FRET-акцептора (и тушителя) в паре с флуоресцеином (FAM) благодаря значительному перекрытию их спектров. Поэтому данный фосфорамидит удобно использовать для синтеза дважды меченых зондов TaqMan, содержащих TAMRA на 5′-конце и FAM в середине последовательности или на 3′-конце (с использованием Флуоресцеин dT фосфорамидита и FAM CPG соответственно).

5′-меченые красителем TAMRA олигонуклеотиды часто используются для количественной ПЦР и фрагментного анализа (например, для анализа микросателлитов), поскольку доступное оборудование часто имеет канал детекции для TAMRA.

Поскольку краситель TAMRA не стабилен в присутствие аммиака и первичных стерически незатрудненных аминов, настоятельно рекомендуется соблюдать указанные условия деблокирования меченых олигонуклеотидов.