Инструкция к набору LumiPure®️ UNI для выделения нуклеиновых кислот из биообразцов методом преципитации
Набор предназначен для выделения тотальной нуклеиновой кислоты из широкого спектра биологических образцов: тканей и органов растений и животных, плазмы крови, лейкоцитов, культур клеток млекопитающих и грамотрицательных бактерий, соскобов эпителиальных клеток, мазков, смывов и др. жидких образцов биологических жидкостей. Полученный препарат тотальной нуклеиновой кислоты подходит для последующего проведения ПЦР и ОТ-ПЦР.
Состав набора
Компонент набора | Количество | |
---|---|---|
34663 100 assays |
||
P7450, Лизирующий раствор NA, 30 mL | 1 | |
R7050, Раствор для преципитации, 40 mL | 1 | |
S8150, Промывочный раствор 1, 50 mL | 1 | |
S6050, Промывочный раствор 2, 50 mL | 1 | |
G5850, Буфер для растворения NA, 5 mL | 1 |
Хранить при температуре от +2°C до +8°C. Транспортировка: до 3 недель при температуре до 30°C или при температуре +2°C до +8°C в пределах всего срока годности.
Срок хранения 12 месяцев.
Необходимое оборудование и материалы, не входящие в состав набора:
- Твердотельный термостат (возможно использование водяной бани);
- Центрифуга с ротором для пробирок объёмом 1,5 мл со скоростью вращения не менее 13000 об/мин (11000 × g);
- Микроцентрифужные пробирки объемом 1,5 мл (1-2 пробирки для выделения из 1 образца);
- Дополнительные материалы (в зависимости от образца):
- ткани растений и животных: жидкий азот, ступка и пестик, вода
- культуры клеток животных и бактерий: натрий-фосфатный буфер (PBS)
- жидкие образцы, мазки и смывы, фекалии: стерильный физиологический раствор
- мокрота: муколизин
Перед началом работы
При наличии осадка в лизирующем растворе NA прогрейте его в термостате до температуры не выше +50°С и дождитесь полного растворения осадка.
Подготовка образца
Ткани растений и животных
В качестве образца для выделения нуклеиновых кислот рекомендуется брать 20-30 мг ткани животного или растения. Для выделения могут использоваться как свежие, так и замороженные образцы тканей.
! Хранение образцов тканей при −70°С в течение нескольких месяцев.
- Поместите свежий или замороженный (−70°С) кусочек ткани в жидкий азот.
- Перенесите замороженный образец ткани в ступку и тщательно гомогенизируйте образец до состояния порошка.
- Пересыпьте порошок в отдельную пробирку объёмом 1,5 мл. Дождитесь испарения жидкого азота, при этом не позволяйте образцу оттаять.
- Добавьте к гомогенату (в указанном порядке): 300 мкл лизирующего раствора NA, 100 мкл воды. Перемешайте.
- Переходите к разделу «Выделение нуклеиновых кислот», пункт 2.
Культуры клеток животных и бактерий
Для выделения нуклеиновых кислот данным набором рекомендуется брать не более 1-2 × 106 животных клеток и 109 клеток грамотрицательных бактерий.
Адгезионная культура клеток животных: удалите культуральную жидкость, снимите культуру клеток с поверхности пластика трипсином или другим рекомендованным для данной культуры методом. Центрифугируйте клетки 5 мин, 300 × g. Удалите супернатант. Ресуспендируйте находящиеся в осадке клетки в 100 мкл PBS. Перенесите суспензию клеток в новую пробирку объёмом 1,5 мл.
Суспензионная культура клеток животных: отберите объём культуральной жидкости, содержащий необходимое число клеток. Центрифугируйте клетки 5 мин, 300 × g. Удалите супернатант. Ресуспендируйте находящиеся в осадке клетки в 100 мкл PBS. Перенесите суспензию клеток в новую пробирку объёмом 1,5 мл.
Бактериальная культура: бактерии, выращенные на твердой или жидкой питательной среде, соберите центрифугированием в течение 5-10 минут, 3000-5000 × g. Удалите супернатант. Ресуспендируйте находящиеся в осадке клетки в 100 мкл PBS. Перенесите суспензию клеток в новую пробирку объёмом 1,5 мл.
Переходите к разделу «Выделение нуклеиновых кислот».
Плазма крови
Данный набор подходит для выделения нуклеиновых кислот из плазмы крови. Для получения плазмы следует использовать образцы цельной периферической крови, содержащие в качестве антикоагулянта ЭДТА в конечной концентрации 2,0 мг/мл или цитрат натрия.
! Не допускается использовать гепарин в качестве антикоагулянта.
! Время от момента взятия периферической крови до получения плазмы не должно составлять более 6 часов.
- Перемешайте переворачиванием пробирку с кровью, чтобы содержимое пробирки стало гомогенным.
- Центрифугируйте пробирку с кровью 20 мин, 900 × g при комнатной температуре (+18-25°С).
- Отберите 100 мкл верхней фракции (плазмы) и перенесите в отдельную пробирку объёмом 1,5 мл.
- Переходите к разделу «Выделение нуклеиновых кислот».
! Хранение плазмы при −20°С не более 3 месяцев.
Соскобы эпителиальных клеток
Данный набор подходит для выделения тотальной нуклеиновой кислоты из соскобов эпителиальных клеток, взятых с помощью одноразового стерильного зонда (буккального эпителия, с задней стенки глотки, носоглотки, из уретры, цервикального канала, заднего свода влагалища и т.д.).
- Внесите 500 мкл физиологического раствора (стерильного) в пробирку объёмом 1,5 мл.
- Тщательно промойте в физиологическом растворе зонд с соскобом эпителиальных клеток. Прижмите к стенке ватный тампон и вращательным движением отожмите из него остатки физиологического раствора.
- Центрифугируйте 10 мин, 11000 × g. Тщательно удалите супернатант.
- Ресуспендируйте осадок в 100 мкл физиологического раствора (стерильного).
- Переходите к разделу «Выделение нуклеиновых кислот».
Моча
- Внесите 1 мл образца мочи в чистую пробирку объёмом 1,5 мл.
- Центрифугируйте 10 мин, 11000 × g. Тщательно удалите супернатант.
- Ресуспендируйте осадок в 1 мл физиологического раствора (стерильного).
- Центрифугируйте 10 мин, 11000 × g. Удалите супернатант.
- Ресуспендируйте осадок в 100 мкл физиологического раствора (стерильного).
- Переходите к разделу «Выделение нуклеиновых кислот».
Слюна, ликвор, синовиальная жидкость
- Внесите 500 мкл образца в отдельную пробирку объёмом 1,5 мл.
- Центрифугируйте 10 мин, 11000 × g. Удалите супернатант, оставив в пробирке около 50 мкл.
- Ресуспендируйте осадок в 500 мкл физиологического раствора (стерильного).
- Центрифугируйте 10 мин, 11000 × g. Удалите супернатант.
- Ресуспендируйте осадок в 100 мкл физиологического раствора (стерильного).
- Переходите к разделу «Выделение нуклеиновых кислот».
Сперма, секрет предстательной железы
- Внесите 100 мкл образца в отдельную пробирку 1,5 мл.
- Добавьте к образцу 500 мкл физиологического раствора (стерильного). Перемешайте содержимое пробирки на вортексе в течение 5-10 сек.
- Центрифугируйте 10 мин, 11000 × g. Удалите супернатант.
- Ресуспендируйте осадок в 100 мкл физиологического раствора (стерильного).
- Переходите к разделу «Выделение нуклеиновых кислот».
Мазки и смывы
- Поместите образец в пробирку для центрифугирования.
- Центрифугируйте 10 мин, 11000 × g. Удалите супернатант.
- Ресуспендируйте осадок в 100 мкл физиологического раствора (стерильного).
- Переходите к разделу «Выделение нуклеиновых кислот».
Фекалии
- Внесите 1 мл физиологического раствора (стерильного) в чистую пробирку объёмом 1,5 мл.
- Поместите в пробирку с физиологическим раствором около 250 мг (мкл) фекалий.
- Перемешайте содержимое пробирки на вортексе в течение 5-10 сек.
- Центрифугируйте 3 мин, 100 × g.
- Перенесите 800-1000 мкл супернатанта в отдельную пробирку 1,5 мл.
- Центрифугируйте 10 мин, 11000 × g. Удалите супернатант.
- Ресуспендируйте осадок в 100 мкл физиологического раствора (стерильного).
- Переходите к разделу «Выделение нуклеиновых кислот».
Мокрота
- В контейнер с образцом добавьте муколизин в соотношении 5:1 (5 частей муколизина : 1 часть мокроты), ориентируясь по градуировке контейнера.
- Закройте крышку контейнера, встряхните содержимое пробирки и инкубируйте 20-30 мин при комнатной температуре, каждые 2-3 мин встряхивая контейнер. ! Обработанную мокроту допускается хранить в контейнере в течение суток при +4°С или долговременно при −20°С.
- Внесите 500 мкл полученного обработанного муколизином образца мокроты в отдельную пробирку объёмом 1,5 мл.
- Центрифугируйте 10 мин, 11000 × g. Удалите супернатант.
- Ресуспендируйте осадок в 100 мкл физиологического раствора (стерильного).
- Переходите к разделу «Выделение нуклеиновых кислот».
Выделение нуклеиновых кислот
Работы следует выполнять при комнатной температуре, все центрифугирования (если иное прямо не оговорено) при скорости >13000 об/мин (>11000 × g).
Перед началом работы установите термостат на +65°С, поместите в него пробирку с буфером для растворения NA.
Подготовьте образец в объеме 100 мкл в пробирке объёмом 1,5 мл согласно разделу «Подготовка образца».
- В пробирку с образцом (100 мкл) добавьте 300 мкл лизирующего раствора NA, тщательно перемешайте содержимое пробирки на вортексе.
- Инкубируйте полученную смесь 15 мин при +65°С.
- (опционально) Если образец после лизиса содержит нерастворенные компоненты, центрифугируйте пробирку с образцом 10 мин. Перенесите супернатант в новую пробирку объёмом 1,5 мл.
- Добавьте к образцу 400 мкл раствора для преципитации, перемешайте на вортексе. Центрифугируйте 15 минут.
- Аккуратно удалите супернатант, не задевая осадок. К осадку добавьте 500 мкл промывочного раствора 1, перемешайте на вортексе. Центрифугируйте 5 мин.
- Аккуратно удалите супернатант, не задевая осадок. К осадку добавьте 500 мкл промывочного раствора 2, перемешайте на вортексе. Центрифугируйте 5 мин.
- Тщательно удалите супернатант, не задевая осадок. Подсушите осадок 5 минут в пробирке с открытой крышкой при +65°С.
- Добавьте 50 мкл предварительно прогретого до +65°С буфера для растворения NA.
- Инкубируйте пробирку с образцом 5-10 минут при +65°С. Перемешайте содержимое пробирки на вортексе, сбросьте капли центрифугированием. Полученный препарат тотальной нуклеиновой кислоты готов для постановки реакции ПЦР/ОТ-ПЦР без дополнительной пробоподготовки.
Хранение выделенной РНК: Из-за нестабильности РНК выделенный образец хранить не рекомендуется. Полученный препарат РНК необходимо сразу использовать для постановки реакции обратной транскрипции.
Хранение выделенной ДНК: кратковременно при +4°С, долговременно при −20°С не более одного месяца или при −70°С не более одного года.