Инструкция к набору LumiPure для выделения плазмидной ДНК (spin-miniprep до 30 мкг)

Данный набор предназначен для быстрого (~ 15 минут) и высокоэффективного выделения плазмидной ДНК (до 30 мкг) из культуры клеток Escherichia coli на спин-колонках. Очищенная ДНК пригодна для любых молекулярно-биологических работ, включая ПЦР, лигирование, трансформацию, обработку эндонуклеазами рестрикции, подготовку образцов для секвенирования по методу Сэнгера и NGS-секвенирования и др.

Состав набора

Компонент набора Количество
21583
50 minipreps
M1250, Ресуспендирующий раствор / Resuspension Solution, 15 mL 1
31650, РНКаза A (10 mg/mL), 150 uL 1
M1550, Лизирующий раствор / Lysis Solution, 15 mL 1
M1450, Нейтрализующий буфер / Neutralization Buffer, 20 mL 1
P2450, Промывочный раствор A / Wash Solution A (с GuHCl), 30 mL 1
K2250, Промывочный раствор B / Wash Solution B (концентрат 5x для разбавления 96% Этанолом), 10.0 mL 2
K1350, Элюирующий буфер / Elution Buffer (10 мМ Tris-HCl, pH 8.5), 10 mL 1
Спин-колонки для очистки ДНК (до 30 мкг) 50
Пробирка для сбора проскока, 2 мл 50

Хранить при комнатной температуре.

Срок хранения 12 месяцев.

Необходимое оборудование и материалы, не входящие в состав набора:

  • Настольная центрифуга с ротором для 1.5 мл пробирок со скоростью вращения не менее 10000 об/мин (6700 x g)
  • Микроцентрифужные пробирки объемом 1.5 мл (2 пробирки для выделения ДНК из 1 образца)
  • 96 % этанол
  • (опционально) Центрифуга с ротором для 15 мл пробирок со скоростью вращения не менее 4500 x g для центрифугирования ночной культуры бактерий (возможно использование настольной центрифуги для 1.5 мл пробирок)

Перед началом работы

  1. Перенесите содержимое пробирки с РНКазой А в ресуспендирующий раствор, тщательно перемешайте. Поставьте отметку о добавлении РНКазы на крышке.
  2. Разбавьте концентрат промывочного раствора B в 5 раз 96 % этанолом (к указанному на банке объему концентрата добавьте 4 объема 96 % этанола), поставьте отметку о добавлении этанола на крышке.
  3. При наличии осадка в лизирующем растворе, нейтрализующем буфере, промывочном растворе А прогрейте их в термостате до температуры не выше 50 °С и дождитесь полного растворения осадка. После этого охладите растворы до 25 °С.

Выделение плазмидной ДНК

Работы следует выполнять при комнатной температуре, все центрифугирования (если иное прямо не оговорено) при 10000–13000 об/мин (6700–11000 x g).

Не используйте для выделения более 30 ОЕ (оптических единиц, OD600) культуры (например, 15 мл при плотности культуры OD600=2 OE). В случае необходимости использовать большее количество клеток для выделения плазмидной ДНК, следует кратно увеличить объемы ресуспендирующего раствора, лизирующего раствора, нейтрализующего буфера, а надосадочную жидкость наносить на колонку в несколько этапов.

  1. 2.5-7 мл ночной культуры бактерий (10-15 мл для низкокопийных плазмид) центрифугируйте 5 минут, 5000 об/мин (4500 x g) или 1 мин, 13000 об/мин (< 10000 x g). Слейте супернатант, полностью удалите остатки культуральной жидкости.

  2. Ресуспендируйте осадок клеток в 250 мкл ресуспендирующего раствора. Перенесите суспензию клеток в новую 1.5 мл пробирку.

  3. Добавьте к суспензии клеток 250 мкл лизирующего раствора, аккуратно перемешайте путем переворачивания пробирки 4-6 раз. Убедитесь, что мутный раствор стал полупрозрачным и вязким, и сразу же переходите к следующему шагу.

    ! В случае выделения плазмидной ДНК из 10-15 мл культуры следует перемешивать до тех пор, пока раствор станет полупрозрачным и вязким, для этого может потребоваться большее число переворачиваний.

    ! Не используйте вортекс для перемешивания, так как это может привести к фрагментации хромосомной ДНК.

  4. Добавьте 350 мкл нейтрализующего буфера, аккуратно перемешайте путем переворачивания пробирки 4-6 раз. После этого этапа в пробирке должны плавать белые хлопья.

    ! В случае выделения плазмидной ДНК из 10-15 мл культуры после перемешивания необходимо кратковременно встряхнуть содержимое пробирки (в течение нескольких секунд).

  5. Центрифугируйте 5 мин.

  6. Поместите колонку в пробирку для сбора проскока, аккуратно перенесите на колонку надосадочную жидкость. Центрифугируйте 30 сек. Извлеките колонку из пробирки, вылейте проскок, поместите колонку обратно.

    ! (Опционально) Для полного удаления нуклеаз при выделении из end A+ штаммов и удаления эндотоксинов нанесите на колонку 500 мкл промывочного раствора А (использование этого раствора может приводить к снижению выхода плазмидной ДНК на 20%). Центрифугируйте 60 сек. Извлеките колонку из пробирки, вылейте проскок, поместите колонку обратно.

  7. Нанесите на колонку 500 мкл промывочного раствора В, центрифугируйте 30 сек. Извлеките колонку из пробирки, вылейте проскок, поместите колонку обратно.

  8. Нанесите на колонку 500 мкл промывочного раствора В, центрифугируйте 3 мин.

  9. Поместите колонку в новую 1.5 мл пробирку, нанесите в центр колонки 50–100 мкл элюирующего буфера. Инкубируйте 1 мин при комнатной температуре. Центрифугируйте 2 минуты. Выделенная ДНК находится в элюате.

    ! Для наибольшей концентрации ДНК используйте меньшие объёмы элюирующего буфера. Не рекомендуется использовать менее 50 мкл, так как мембрана колонки может не полностью смочиться, что приведет к частичной потере ДНК. Для наибольшего выхода ДНК с колонки используйте больший объём элюирующего буфера (100 мкл).

    ! При необходимости элюцию можно проводить деионизованной водой.

Примечание

Если необходимо разбавить раствор при измерении концентрации ДНК, то для разбавления следует использовать только буфер ТЕ pH 8.5 или элюирующий буфер из набора. В противном случае можно получить некорректные значения A260/A280 и неверно определить содержание ДНК в растворе.

Хранение выделенной ДНК: в морозильной камере (−20 °С), кратковременно при +4 °С

Наборы

Набор LumiPure для выделения плазмидной ДНК (Spin Miniprep)

Набор для быстрого и высокоэффективного выделения плазмидной ДНК из культур клеток Escherichia coli на спин-колонках.
Показать цены
Артикул Фасовка Цена Срок поставки
21583 50 minipreps $65.00 в наличии

Товар добавлен. Просмотрите корзину покупок или оформите заказ
Введено некорректное число товаров для добавления.