Мечение белков с помощью пирилиевых красителей
Пирилиевые красители — флуорогенные, реакционноспособные по отношению к первичным аминам красители, образующие флуоресцентные продукты после конъюгации с первичными аминогруппами пептидов, белков и других биомолекул.
В свободном состоянии пирилиевые красители практически не обладают флуоресценцией, однако, их квантовый выход возрастает в десятки раз после конъюгации с первичными аминами. Одновременно с этим наблюдается коротковолновый спектральный сдвиг флуоресценции красителя. Сдвиг спектров возбуждения/испускания и повышение квантового выхода после конъюгации способствуют значительному снижению фона от несвязанного красителя. Несвязанный краситель также гидролизуется во время процедуры мечения. Все это позволяет метить молекулы, содержащие амины, с помощью простой одноэтапной инкубации при комнатной температуре без каких-либо дополнительных этапов очистки.
Меченные пирилиевыми красителями пептиды и белки готовы к использованию сразу после конъюгации. Поэтому они могут быть использованы в таких приложениях, как гель-электрофорез с SDS, капиллярный электрофорез, изоэлектрическое фокусирование и др. Пирилиевые красители также используют в качестве флуоресцентной метки в исследованиях связывания рецепторов.
Ниже приводится типовой протокол для мечения белков с помощью пирилиевых красителей.
Приготовление растворов
-
Приготовление стокового раствора красителя
- Растворите 1 мг красителя в 100 мкл диметилформамида. Важно! Не используйте в качестве растворителя аминосодержащие растворы или буферы.
- Стоковый раствор можно хранить в темноте при температуре 4 °C в течение 6 месяцев.
-
Приготовление 0,1 М бикарбонатного буфера (pH 8,3)
- Растворите 4,2 г NaHCO3 в 500 мл бидистиллированной воды.
- Доведите буфер до pH 8,3 с помощью 1 N NaOH.
-
Приготовление 22 мМ фосфатного буфера (pH 7,2)
- Растворите 5,67 г Na2HPO4×12H2O и 0,96 г NaH2PO4×2H2O в 1 л бидистиллированной воды.
- Доведите буфер до pH 7,2 с помощью 1 N HCl.
Мечение белков
- Растворите 2 мг белка в 0,5 мл бикарбонатного буфера (pH 8,3).
- Добавьте по каплям 5–10 мкл рабочего раствора пирилия-1, -4 или -6 к раствору белка. Добавьте по каплям 10–20 мкл рабочего раствора пирилия-8 к раствору белка.
-
Осторожно перемешивайте реакционную смесь при комнатной температуре в течение указанного времени:
- 30 мин — для пирилия-1;
- 1 ч — для пирилия-4 и -6;
- 2 ч — для пирилия-8.
- При инкубации в основной среде реакционная смесь поменяет цвет с синего (пирилий-1), фиолетового (пирилий-4) или пурпурного (пирилий-6) на желтый.
- Несвязанный краситель гидролизуется во время процедуры мечения, поэтому меченные пирилиевыми красителями пептиды и белки готовы к использованию сразу после конъюгации.
Очистка конъюгированного белка
Для некоторых применений может потребоваться очистка конъюгированного с красителем белка.
Меченый белок очищается с помощью гель-хроматографии с использованием Sephadex G25 в качестве неподвижной фазы и 22 мМ фосфатного буфера (pH 7,2) в качестве элюента. Красная полоса указывает на меченый белок.
Похожие товары
Пирилий-1 (Py-1)
Флуорогенный, реакционноспособный по отношению к первичным аминам полиметиновый краситель с эмиссией 600 нм для простого одноэтапного мечения пептидов и белков.Артикул | Фасовка | Цена | Срок поставки | Купить товар |
---|---|---|---|---|
4698-1mg | 1 mg | $409 $329 | в наличии |
Пирилий-4 (Py-4)
Флуорогенный, реакционноспособный по отношению к первичным аминам полиметиновый краситель с эмиссией 590 нм для простого одноэтапного мечения пептидов и белков.Артикул | Фасовка | Цена | Срок поставки | Купить товар |
---|---|---|---|---|
4750-1mg | 1 mg | $299 $272 | в наличии |
Пирилий-6 (Py-6)
Флуорогенный, реакционноспособный по отношению к первичным аминам полиметиновый краситель с эмиссией 627 нм для простого одноэтапного мечения пептидов и белков.Артикул | Фасовка | Цена | Срок поставки | Купить товар |
---|---|---|---|---|
4719-1mg | 1 mg | $299 $272 | в наличии |
Пирилий-8 (Py-8)
Флуорогенный, реакционноспособный по отношению к первичным аминам полиметиновый краситель с эмиссией 536 нм для простого одноэтапного мечения пептидов и белков.Артикул | Фасовка | Цена | Срок поставки | Купить товар |
---|---|---|---|---|
4751-1mg | 1 mg | $599 | в наличии |